Samostan so nazadnje temeljito obnovili frančiškani beneške province takoj po koncu druge svetovne vojne. V času delovanja zaporov je bilo v sami zgradbi opravljenih več predelav in popravil, ki pa niso pripomogla k ohranitvi arhitekturne podobe starega samostana.
Ko je bila stavba izročena v posest frančiškanov, so ti leta 2005 pričeli z obnovo samostana. Veliko dela je bilo opravljenega, na obnovo pa še čakajo naslednji prostori: galerija, knjižnica, križni hodnik, atrij, fasada in prostori ob cerkvi sv. Ane.